办理投标保函的流程相对严谨，但每一步都至关重要。以下是具体的办理步骤：
1、准备资料：
招标文件资料：包括招标公告、招标文件等。
基础交易合同资料及履约记录：提供公司对同类项目的履约记录，以证明公司的履约能力和信誉。
常规授信资料：如营业执照、法人代码证书、税务登记证、财务报表、公司决议等，这些资料是银行评估申请人资质的重要依据。
保函格式：通常招标文件中会提供要求的保函格式文本，申请人需按照要求填写。
2、填写申请：
申请人需填写《保函申请书》，并附上上述所有准备好的资料。
3、银行审查：
银行将对申请人的申请内容进行审查，包括资质、信用状况、履约能力等。
4、签订协议：
审查通过后，银行与申请人签订协议，明确双方的权利和义务。申请人需按照协议要求提供相应的担保措施。
5、开立保函：
银行根据协议内容，为申请人开立投标保函。保函的有效期一般不超过六个月，从开出之日起生效。
6、提交保函：
申请人将开立好的投标保函随同投标文件一并提交给招标人。
预付款保函,又称还款保函，指担保人(银行)根据申请人(合同中的预收款人，通常情况下是出口商)的要求向受益人(合同中的预付款人，通常是进口商)开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺。
预付款保函在国际承包业务中使用时，是由承包人通过银行向业主提供。保证书规定，如申请人不履行他与受益人订立的合同的义务，不将受益人预付、支付的款项退还或还款给受益人，则由银行向受益人退还该款项。
预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。如出口人不能按期交货，银行保证及时偿还进口人已付款项的本金及所产生的利息。
预付款保函的有效期：
从理论上讲，保函的目的是为了防止卖方不按合同规定交货而买方损失预付款，当卖方履行了交货义务后，保函的作用也就完成了。所以绝大部分保函的有效期从开立日始到装船日但不超过合同迟装船期，原则上说是对的。
保函实际失效时间先于卖方履行交货义务的后期限。对失效地点在中国的保函，当保函失效时，由于时差关系，对于美国卖方而言，还有十几小时才到迟装船期。
买方无时间办理索偿手续。对失效地点在卖方所在地的保函，当买方获知卖方未能在迟装船期内履行交货义务，此时保函时效也已到，由于地理位置的差异，买方已没有时间办理有关索偿手续。所以我们应要求保函有效期至合同迟装船期后几个工作日较妥。我们之所以强调是“工作日”主要考虑遇到节假日的情况。