医院学科设置齐全，设有6个专科病院， 60个临床医技科室、以及多个科研实验机构、编辑部等其他业务部门。是国家疑难病症诊治能力提升工程项目资助单位、国家区域医疗中心建设及能力输出单位（呼吸与危重症医学科）；国家中西医协同“旗舰”医院试点项目建设单位；有生物诊断国家地方联合工程研究中心、全国医疗机构医学人工智能研究院、全国大数据算法与分析技术国家工程实验室；泌尿外科、皮肤科系国家重点学科；骨外科、消化内科、临床专科护理、地方病科(地方性骨病、心肌病、碘相关及甲状腺疾病)、麻醉科、皮肤科、呼吸内科、耳鼻咽喉头颈外科、急诊科、中医科等10个学科为国家临床重点专科；小儿外科、肿瘤病院、心血管病院、神经病院4个国家重大疾病多学科合作诊疗能力建设项目；陕西省生物与转化医学工程研究中心、陕西省胃肠动力疾病研究重点实验室2个省级工程中心和重点实验室；皮肤科、消化内科、医用超声研究室、小儿外科、急诊科、手术室、康复医学科、泌尿外科、供应科等9个省级医疗质控中心。
医院是首批国家临床教学培训示范中心，临床技能实验教学示范中心，设有17个学科系、2个教研室。承担着博士后、博士、硕士、本科生、留学生多个层次的教学培养任务和国家继续医学教育项目、陕西省全科医师培训工作，培养的上万名高级医学人才遍及全国各地及世界。承担国家卫生部高等医药院校统编教材编修任务，获得数十项国家、省部级教学成果奖和现代教育技术成果奖。现为“临床技能实验教学示范中心”、全国“住院医师规范化培训基地”“专科医师规范化培训制度试点基地”，陕西省“研究生示范性联合培养基地”。
严格规范的管理体系，大医精诚、尊师重教的文化传承，使得医院多次受到国家和上级表彰。曾两次获卫生部等部委联合授予的“全国医药卫生系统先进集体”;中央文明委授予的“全国文明单位"及全国总工会“抗震救灾重建家园工人先锋号”称号，连续获得“陕西省三八红旗手(集体)”及“优质护理示范工程先进医院” “陕西省抗疫先进集体”等称号。医院多名医护人员先后获得国际南丁格尔奖、国家五一劳动奖、全国卫生系统先进个人、中国医师奖、全国先进教师、全国抗疫先进个人、中国五四青年奖章、全国及陕西省白求恩精神奖、全国护士、陕西省护士，陕西省共产党员、陕西省抗疫先进个人、陕西省五四青年奖章、三秦美医务工作者等荣誉。
为了满足人民群众不断增长的就医需求，突破老城区医院物理空间发展受限的瓶颈，医院提出以院本部为中心，“压旧扩新”、优质医疗资源向周边辐射扩展的发展战略，清晰绘制出“一院多区”蓝图框架及国家区域医疗中心技术输出洛阳医院、新疆医院、杨凌示范区医院，实现与主院区各个专业的同质拓展。