北中医三院目前编制床位520张，有34个临床科室，5个医技科室，4个门诊部，3个社区卫生服务站;医院有正高职称专家62名，副高职称专家113名，具有博士学位人员161名，硕士学位人员204名。医院有北京中医药大学经方现代临床应用研究所、北京中医药大学骨伤科研究所。
北京中医药大学第三附属医院针灸微创肿瘤科黄金昶医生代挂号预约“待病人如亲人，提高病人满意度”始终是北京小申就医跑腿服务坚持不渝的服务理念。简单说：北京小申就医跑腿，只需提供有效证件就能帮你挂上号。
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北中医三院拥有磁共振成像系统、瑞典医科达Precise直线加速器、德国Siemens数字减影血管成像系统（DSA）、消化内镜诊疗系统等大型进口诊疗设备，为医院的急危重症救治提供了完善的技术保障。